হাটহাজারী মাদরাসার পূর্ণাঙ্গ মহাপরিচালক হয়েছেন আল্লামা মুহাম্মদ ইয়াহইয়া হাফিযাহুল্লাহু। সাবেক মহাপরিচালক আল্লামা মুফতী আব্দুস সালাম চাটগামী রহিমাহুল্লাহুর ইন্তেকালের পর থেকে তিনি ভারপ্রাপ্ত মহাপরিচালক হিসেবে দায়িত্ব পালন করছিলেন।
গতকাল অনুষ্ঠিত মজলিশে শূরার বৈঠকে ভারমুক্ত করে পূর্ণাঙ্গ মোহতামীম ঘোষণা করা হয় তাকে। মুফতী জসিম উদ্দিনকে সহযোগী পরিচালক, আল্লামা কবির আহমদকে শিক্ষা পরিচালক, মুফতী খলিল আহমাদকে সহকারী শিক্ষা পরিচালক, মাওলানা ফোরকানকে হোস্টেল সুপার ও মুফতী আবু সাঈদকে বোডিং সুপারের দায়িত্ব প্রদান করা হয়। এছাড়াও আল্লামা শেখ আহমদকে প্রধান শায়খুল হাদীস হিসেবে পুনর্বহাল রাখা হয়েছে।